Существуют особые ферменты, без которых невозможна никакая генно-инженерная манипуляция. Эти ферменты называются рестриктазы. Они являются своеобразными ножницами. Режут ДНК в строго определённых последовательностях. Образно говоря, ДНК - это длинный текст на телеграфной ленте, а рестриктазы узнают определённые слова и разрезают эту ленту по строго определённым словам.
Слова в ДНК состоят из четырёх букв - аденина, цитозина, гуанина и тимина. Дело в том, что в ДНК млекопитающих, в том числе и человека, часть цитозина метилирована.
В 2004 году в нашей компании ООО "СибЭнзайм" было совершено открытие. Был найден принципиально новый класс ДНК-эндонуклеаз - ферментов, разрезающих ДНК по строго определённым последовательностям, но только МЕТИЛИРОВАННЫМ ПО ЦИТОЗИНУ. До 2004 года никто и не предполагал, что такие ферменты существуют.
Сейчас в компании найдено уже около десятка такого рода ферментов, а в каталоге фирмы их уже 5, и мы являемся пока единственной в мире компанией производящей такого рода ферменты.
Практичекое применение -
- Диагностика онкологических заболеваний. В настоящее время идёт совместная работа с Томским медицинским университетом про разработке новых методов диагностики онкологических заболеваний пока на клеточных культурах человека.
- анализ статуса метилирования ДНК.
Образно говоря, данные ферменты, являются неким "зазеркальем" (и довольно богатым на виды) обычных рестриктаз.
Ищем сотрудничества для применения этого принципиально нового класса ферментов.
Литература по описанию новых ферментов. Статьи можно скачать здесь
1. Чернухин В.А., Чмуж Е.В., Томилова Ю.Э., Наякшина Т.Н., Гончар Д.А., Дедков В.С., Дегтярев С.Х. Новая сайт-специфическая эндонуклеаза GluI узнает метилированную последовательность ДНК 5’-G(5mC)^NG(5mC)-3’/3’-(
2. Чернухин В.А., Томилова Ю.Э., Чмуж Е.В., Соколова О.О., Дедков В.С., Дегтярев С.Х. Сайт-специфическая эндонуклеаза BlsI узнает последовательность ДНК 5’-G(5mC)N^GC-3’ и расщепляет ее с образованием 3’-выступающих концов.// Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю.А.Овчинникова, Т3, №1, С. 28-33 (2007).
3. Чернухин В.А., Чмуж Е.В., Томилова Ю.Э., Наякшина Т.Н., Дедков В.С., Дегтярев С.Х. Штамм бактерий Glacial ice bacterium - продуцент сайт-специфической эндонуклеазы Glu I. // Патент на изобретение RU 2322492 С1 (2006).
4. Чернухин В.А., Томилова Ю.Э., Чмуж Е.В., Соколова О.О., Дедков В.С., Дегтярев С.Х. Штамм бактерий Bacillus simplex - продуцент сайт-специфической эндонуклеазы Bls I. // Патент на изобретение RU 2322494 С1 (2006).
5. Чернухин В.А., Наякшина Т.Н., Мезенцева Н.В., Томилова Ю.Э., Дегтярев С.Х., Дедков В.С. Штамм бактерий Glacial ice bacterium I - продуцент эндонуклеазы рестрикции Gla I. // Патент на изобретение RU 2287012 С1 (2006).
6. Чернухин В.А., Наякшина Т.Н., Абдурашитов М.А., Томилова Ю.Э., Мезенцева Н.В., Дедков В.С., Михненкова Н.А., Гончар Д.А., Дегтярев С.Х. Новая эндонуклеаза рестрикции GlaI узнает метилированную последовательность 5'-G(5mC)^GC-3'. //Биотехнология, №4, С.31-35 (2006).
Литература по применению этих ферментов в анализе статуса метилирования геномов млекопитающих. Можно скачать здесь
1. В.А. Чернухин, М.А. Абдурашитов, В.Н. Томилов, Д.А. Гончар, С.Х. Дегтярев Сравнительный рестрикционный анализ хромосомной ДНК мыши in vitro и in silico. // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю. А. Овчинникова, 2007, 3, №4, с. 19-27.
2. Abdurashitov M.A., Chernukhin V.A, Gonchar D.A., Degtyarev S.Kh. GlaI digestion of mouse gamma-satellite DNA: study of primary structure and ACGT sites methylation. // BMC Genomics 2009, 10:322